计算机学院是在1980年设立的本科计算机专业的基础上发展起来的。1980年9月开始面向全国招收了第一批计算机应用专业本科生，1981年开始招收计算机应用技术硕士研究生。1984年5月设立的电子计算机系。2000年7月，为适应信息学科快速发展的需要，成立计算机学院。2001年7月，经浙江省教育厅批准，以计算机学院为依托，成立浙江省省属高校第一家软件学院。2002年7月软件学院独立建制。2004年10月，计算机学院与软件学院合并，组成新的计算机学院。2009年12月，学校决定在软件学院的基础上成立软件工程学院。2015年3月11日，撤销计算机学院、软件工程学院，成立新的计算机学院。同时成立软件学院，计算机学院和软件学院合署办学，实行“一套班子、两块牌子”。
1993年获得计算机应用技术硕士学位授予权，1998年获得计算机软件与理论硕士学位授予权，2003年学院获得计算机技术、软件工程两个领域的工程硕士学位授予权，2005年获得计算机科学与技术一级学科硕士学位授予权和二级学科计算机系统结构硕士学位授予权。2000年计算机应用技术成为省重点学科，计算机软件与理论成为原信息产业部重点学科，2004年计算机科学与工程成为浙江省重点学科（A类）。2008年计算机应用技术成为浙江省高校重中之重学科，2009年获得计算机科学与技术一级学科博士学位授予权立项建设。2011年8月经国务院学位委员会批准，软件工程获得一级学科硕士学位授予权。2012年1月依托一级学科计算机科学与技术增设两个目录外二级学科：物联网技术、数字媒体技术（2013年开始招生）2013年7月成为浙江省属高校中唯一的计算机科学与技术博士学位授权一级学科点，并于2014年招收博士生；2016年1月被浙江省遴选为“十三五”首批一流学科（A类）。2019年9月，人力资源社会保障部、全国博士后管理委员会联合下文“计算机科学与技术”一级学科获批设立博士后科研流动站。2017年12月，教育部学位与研究生教育发展中心公布全国第四轮学科评估结果，计算机科学与技术学科在全国第四轮学科评估中获B+（前10%-20%），在浙江省属高校中排名第一。2017中国科学评价研究中心最新学科排名，计算机学科在全国281个同类学科中排名24位，进入全国计算机学科前10%。2018年5月，计算机科学学科排名实现历史突破，首次进入ESI全球排名前1%，在进入全球前1%的409个研究机构中排名第369位，在大陆高校中排名第45位。
目前学院拥有计算机科学与技术（1980年）、软件工程（2003年）二个本科专业，其中“计算机科学与技术”是国家特色建设专业、国家管理专业、国家工程教育认证专业（2015.1—2023.12）、教育部“本科教学工程”地方高校第一批综合改革试点专业、浙江省本科院校“十二五”优势专业、浙江省本科院校“十三五”优势专业建设项目；“软件工程”是国家级卓越工程师教育培养计划专业、国家级高等学校特色专业建设点专业、国家工程教育认证专业（2019.1——2024.12）、浙江省培养服务外包人才试点专业、浙江省普通高校重点专业、浙江省本科院校“十三五”优势专业建设项目。
学院拥有一支结构合理、具有较高学术水平与研究能力的学科梯队，现有教职工180余人，专任教师150余人，其中博士生导师23人、教授35人(其**聘教授4人)、副教授57人、具有博士学位教师127人。学院拥有共享院士1人，国家千*1人，国家杰青1人，国家优青1人，教育部国家青年**1人，教育部“新世纪优秀人才支持计划”2人，国家百千万人才1人，浙江省“万*计划”科技创新领军人才3人，浙江省“万*计划”青年拔尖人才2人，浙江省高等学校“钱江高级人才”（特聘教授）2人，浙江省中青年突出贡献专家1人，浙江省“151人才工程”一层次3人，二层次2人,三层次15人，浙江省中青年学科带头人9人，浙江省教学名师1人、浙江省优秀教育工作者1人。现有在读本科生2000余人，研究生790余人。