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原标题:登Nature子刊!华中师范大学提出DigFrag,用AI精准分割分子片段,并生成44个药物/农药分子
文章来源:HyperAI超神经
内容字数:7937字
数字化分段方法 DigFrag 的创新与应用
近期,华中师范大学的研究团队开发了一种名为 DigFrag 的数字化分段方法,这一创新在药物发现领域展现出巨大的潜力。DigFrag 通过局部聚焦于分子图,强调关键子结构并将其分割成片段,进而生成符合预期化学特性的化合物。该方法不仅提高了片段结构的多样性,还为基于片段的药物发现(FBDD)提供了新的解决方案。
1. FBDD 的挑战与 AI 的引入
虽然 FBDD 在药物研发中起着关键作用,但有效的分子片段库构建一直是个挑战。传统方法多依赖经验直觉,难以实现结构的多样化。AI 的出现为这一难题带来了新的机遇,DigFrag 的开发就是一个典型例子。通过 AI 技术,该方法能从机器学习的角度出发,识别和生成更为多样化的分子片段。
2. DigFrag 的工作流程与优势
DigFrag 的工作流程分为三个步骤:首先,基于图神经网络对分子进行片段化;其次,整合多种分段方法(如 BRICS、RECAP、MacFrag)以提升生成能力;最后,建立用户友好的在线平台 MolFrag,支持多种分子分析和设计。实验表明,DigFrag 生成的片段在结构多样性上优于传统方法,特别是在片段的可旋转键数量和独特性方面。
3. 实验结果与模型评价
研究采用五折交叉验证对 DigFrag 方法进行评估,结果显示其生成的药物和农药片段在多个关键性能指标上表现出色,尤其在分子量、QED 和 SA 属性分布上与 MOSES 数据集的相似性最高。此外,DigFrag 模型生成的分子在毒性和稳定性方面也展现出更高的安全性,为药物开发提供了更可靠的基础。
4. 未来展望与 AI 的重要性
随着 AI 技术的发展,其在药物发现与设计中的应用越来越深入。DigFrag 和其他相关模型的成功应用表明,AI 能够有效提升药物研发的效率和成功率,为患者提供更安全、更有效的治疗方案。未来,我们可以期待 AI 在药物开发领域带来更多创新和突破。
总之,DigFrag 方法为药物发现领域提供了一种新的思路和解决方案,结合 AI 技术的应用,极大地推动了分子设计的进步,展现出广阔的应用前景。
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作者简介:解构技术先进性与普适性,报道更前沿的 AIforScience 案例